一体化污水处理设备在正确安装完成后，在运行前，首先需要检查风机的润滑油是否加满，电路连接是否可靠，管道连接是否牢固，检查完毕后，将一体化污水处理设备注入清水，检查各管路、箱体是否有渗漏情况，检查完毕后，单电机试运行，空转点试设备的风机、电机的正反转，确保各电机正转运行。
第二，启动风机，检查一体化污水处理设备曝气是否正常；启动各水泵，检查管路连接是否正常。
第三，检查完毕无误后，开启手动模式，注入半箱水，启动曝气风机，加入活性污泥，将二沉池污泥回流泵时间继电器调整到所需要的模式。
第四，污水注满接触氧化池，启动风机，对好氧池内污水进行曝气，重新注水，继续曝气，如此反复运行，每天进水时间相对延长，同时观察接触氧化池内填料情况，经过较长时间的驯化，可加快生物膜的形成。
