扇贝加工污水主要来自扇贝清洗污水及扇贝蒸煮污水，污水中的主要污染物为悬浮物和有机物，其中废水的B/C>0.4，具有良好的可生化性。根据其废水的特性，经过几种方案的对比，本设计方案考虑采用以生物处理法为主、以物理化学法处理为辅的处理方法，污水中含盐较高，宜采用高盐菌种。
扇贝加工污水首先进入调节池，调节池可以对水量、水温及水质进行调节。调节池出水由提升泵提升至高效气浮机。去除废水中大部分SS和浮油，气浮出水进入厌氧池，将难生物降解的大分子物质转化为易生物降解的小分子物质的过程，从而改善废水的可生化性，为后续处理奠定良好基础。然后通过厌氧微生物的作用去除废水中的大部分有机物。经厌氧处理后的污水进入“生物接触氧化池”处理工艺段进行生化处理，降解水中剩余的有机物、氨氮等，出水经过“二沉池”进行泥水分离，上清液进入除磷池，通过加药装置加入除磷剂并经过搅拌装置充分搅拌除磷后进入竖片式滤布滤池，经过竖片式滤布滤池深度处理后达标排放。
